Muchos usuarios advirtieron que algunas aplicaciones dejaron de funcionar correctamente tras la instalación del Service Pack 2 (SP2). Algunos precisaron que productos no desarrollados por Microsoft, como los navegadores de Mozilla Foundation u Opera, presentan problemas.

Pocos usuarios dijeron que la instalación del parche les obligo a rehacer partes de las aplicaciones que son usadas por la organización.

Un portavoz de Microsoft señaló que están trabajando con los desarrolladores de productos independientes para solucionar los problemas que se derivan de la instalación y el conflicto que pueda producirse con otras herramientas.